Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE63

HIPK4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK4Q8NE63 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HIPK4Q8NE63 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HIPK4Q8NE63 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HIPK4Q8NE63 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HIPK4Q8NE63 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HIPK4Q8NE63 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HIPK4Q8NE63 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIPK4Q8NE63 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIPK4Q8NE63 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIPK4Q8NE63 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HIPK4Q8NE63 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIPK4Q8NE63 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIPK4Q8NE63 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIPK4Q8NE63 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIPK4Q8NE63 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIPK4Q8NE63 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIPK4Q8NE63 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIPK4Q8NE63 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HIPK4Q8NE63 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HIPK4Q8NE63 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HIPK4Q8NE63 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HIPK4Q8NE63 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HIPK4Q8NE63 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HIPK4Q8NE63 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HIPK4Q8NE63 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HIPK4Q8NE63 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HIPK4Q8NE63 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HIPK4Q8NE63 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HIPK4Q8NE63 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HIPK4Q8NE63 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HIPK4Q8NE63 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms