Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYM2

SLFN12, Schlafen family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN12Q8IYM2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.4 ms