Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HERC6Q8IVU3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms