Protein–RNA interactions for Protein: Q86UX7

FERMT3, Fermitin family homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FERMT3Q86UX7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FERMT3Q86UX7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FERMT3Q86UX7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FERMT3Q86UX7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FERMT3Q86UX7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FERMT3Q86UX7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FERMT3Q86UX7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FERMT3Q86UX7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FERMT3Q86UX7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FERMT3Q86UX7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FERMT3Q86UX7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FERMT3Q86UX7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FERMT3Q86UX7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FERMT3Q86UX7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FERMT3Q86UX7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FERMT3Q86UX7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FERMT3Q86UX7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FERMT3Q86UX7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FERMT3Q86UX7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FERMT3Q86UX7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FERMT3Q86UX7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FERMT3Q86UX7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FERMT3Q86UX7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FERMT3Q86UX7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FERMT3Q86UX7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FERMT3Q86UX7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FERMT3Q86UX7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FERMT3Q86UX7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FERMT3Q86UX7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FERMT3Q86UX7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FERMT3Q86UX7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FERMT3Q86UX7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FERMT3Q86UX7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FERMT3Q86UX7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FERMT3Q86UX7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FERMT3Q86UX7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FERMT3Q86UX7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FERMT3Q86UX7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FERMT3Q86UX7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms