Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC84Q86UT8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms