Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms