Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms