Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGC8

CHST3, Carbohydrate sulfotransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST3Q7LGC8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHST3Q7LGC8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHST3Q7LGC8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHST3Q7LGC8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHST3Q7LGC8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHST3Q7LGC8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHST3Q7LGC8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHST3Q7LGC8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CHST3Q7LGC8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHST3Q7LGC8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CHST3Q7LGC8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHST3Q7LGC8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHST3Q7LGC8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHST3Q7LGC8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHST3Q7LGC8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHST3Q7LGC8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHST3Q7LGC8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHST3Q7LGC8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms