Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms