Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSY5

PPP1R3F, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3FQ6ZSY5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPP1R3FQ6ZSY5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms