Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFXL1Q6ZNB6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms