Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms