Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms