Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms