Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF3

SCIMP, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCIMPQ6UWF3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCIMPQ6UWF3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCIMPQ6UWF3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCIMPQ6UWF3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCIMPQ6UWF3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCIMPQ6UWF3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCIMPQ6UWF3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCIMPQ6UWF3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCIMPQ6UWF3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCIMPQ6UWF3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCIMPQ6UWF3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCIMPQ6UWF3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCIMPQ6UWF3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SCIMPQ6UWF3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCIMPQ6UWF3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCIMPQ6UWF3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCIMPQ6UWF3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCIMPQ6UWF3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCIMPQ6UWF3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCIMPQ6UWF3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCIMPQ6UWF3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCIMPQ6UWF3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCIMPQ6UWF3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCIMPQ6UWF3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCIMPQ6UWF3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCIMPQ6UWF3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCIMPQ6UWF3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCIMPQ6UWF3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCIMPQ6UWF3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCIMPQ6UWF3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCIMPQ6UWF3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCIMPQ6UWF3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCIMPQ6UWF3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCIMPQ6UWF3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCIMPQ6UWF3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCIMPQ6UWF3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCIMPQ6UWF3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SCIMPQ6UWF3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SCIMPQ6UWF3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCIMPQ6UWF3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCIMPQ6UWF3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCIMPQ6UWF3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCIMPQ6UWF3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SCIMPQ6UWF3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCIMPQ6UWF3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCIMPQ6UWF3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCIMPQ6UWF3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCIMPQ6UWF3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCIMPQ6UWF3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCIMPQ6UWF3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCIMPQ6UWF3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCIMPQ6UWF3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCIMPQ6UWF3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCIMPQ6UWF3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCIMPQ6UWF3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms