Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms