Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms