Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCAPH2Q6IBW4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms