Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms