Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.2 ms