Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms