Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC39A12Q504Y0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC39A12Q504Y0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC39A12Q504Y0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC39A12Q504Y0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC39A12Q504Y0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC39A12Q504Y0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC39A12Q504Y0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC39A12Q504Y0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC39A12Q504Y0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC39A12Q504Y0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC39A12Q504Y0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC39A12Q504Y0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC39A12Q504Y0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms