Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
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