Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPROQ16827 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
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