Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMA4Q16363 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms