Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TLR1Q15399 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TLR1Q15399 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TLR1Q15399 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TLR1Q15399 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TLR1Q15399 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TLR1Q15399 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TLR1Q15399 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TLR1Q15399 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TLR1Q15399 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TLR1Q15399 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TLR1Q15399 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TLR1Q15399 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TLR1Q15399 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TLR1Q15399 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TLR1Q15399 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TLR1Q15399 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TLR1Q15399 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TLR1Q15399 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TLR1Q15399 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TLR1Q15399 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TLR1Q15399 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TLR1Q15399 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TLR1Q15399 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TLR1Q15399 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TLR1Q15399 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TLR1Q15399 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TLR1Q15399 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TLR1Q15399 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TLR1Q15399 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TLR1Q15399 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TLR1Q15399 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TLR1Q15399 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TLR1Q15399 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TLR1Q15399 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TLR1Q15399 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TLR1Q15399 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TLR1Q15399 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TLR1Q15399 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TLR1Q15399 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TLR1Q15399 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TLR1Q15399 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TLR1Q15399 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TLR1Q15399 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TLR1Q15399 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TLR1Q15399 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TLR1Q15399 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TLR1Q15399 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TLR1Q15399 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TLR1Q15399 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TLR1Q15399 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TLR1Q15399 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TLR1Q15399 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TLR1Q15399 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TLR1Q15399 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TLR1Q15399 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TLR1Q15399 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TLR1Q15399 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TLR1Q15399 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.83
TLR1Q15399 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.83
TLR1Q15399 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TLR1Q15399 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TLR1Q15399 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TLR1Q15399 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TLR1Q15399 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TLR1Q15399 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TLR1Q15399 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TLR1Q15399 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TLR1Q15399 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TLR1Q15399 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TLR1Q15399 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TLR1Q15399 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TLR1Q15399 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TLR1Q15399 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TLR1Q15399 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TLR1Q15399 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TLR1Q15399 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TLR1Q15399 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TLR1Q15399 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TLR1Q15399 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TLR1Q15399 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TLR1Q15399 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TLR1Q15399 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TLR1Q15399 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TLR1Q15399 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TLR1Q15399 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TLR1Q15399 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TLR1Q15399 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TLR1Q15399 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TLR1Q15399 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TLR1Q15399 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TLR1Q15399 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TLR1Q15399 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TLR1Q15399 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TLR1Q15399 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TLR1Q15399 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TLR1Q15399 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TLR1Q15399 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TLR1Q15399 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TLR1Q15399 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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