Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms