Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
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