Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

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Length 389 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PSMD6Q15008 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
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