Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PCLAFQ15004 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCLAFQ15004 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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