Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SHPRHQ149N8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
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