Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNC3Q14003 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNC3Q14003 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNC3Q14003 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNC3Q14003 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNC3Q14003 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNC3Q14003 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNC3Q14003 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNC3Q14003 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNC3Q14003 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNC3Q14003 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNC3Q14003 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNC3Q14003 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNC3Q14003 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNC3Q14003 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNC3Q14003 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNC3Q14003 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNC3Q14003 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNC3Q14003 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNC3Q14003 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNC3Q14003 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNC3Q14003 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNC3Q14003 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNC3Q14003 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNC3Q14003 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNC3Q14003 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNC3Q14003 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNC3Q14003 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNC3Q14003 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNC3Q14003 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNC3Q14003 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNC3Q14003 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNC3Q14003 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNC3Q14003 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNC3Q14003 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNC3Q14003 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNC3Q14003 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNC3Q14003 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNC3Q14003 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNC3Q14003 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNC3Q14003 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNC3Q14003 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNC3Q14003 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNC3Q14003 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNC3Q14003 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNC3Q14003 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCNC3Q14003 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCNC3Q14003 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCNC3Q14003 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNC3Q14003 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNC3Q14003 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNC3Q14003 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNC3Q14003 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNC3Q14003 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNC3Q14003 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNC3Q14003 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNC3Q14003 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNC3Q14003 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNC3Q14003 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNC3Q14003 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNC3Q14003 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNC3Q14003 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNC3Q14003 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNC3Q14003 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNC3Q14003 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNC3Q14003 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNC3Q14003 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNC3Q14003 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNC3Q14003 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNC3Q14003 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNC3Q14003 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNC3Q14003 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNC3Q14003 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNC3Q14003 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNC3Q14003 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNC3Q14003 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNC3Q14003 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNC3Q14003 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNC3Q14003 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNC3Q14003 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNC3Q14003 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNC3Q14003 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNC3Q14003 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNC3Q14003 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNC3Q14003 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNC3Q14003 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNC3Q14003 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNC3Q14003 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNC3Q14003 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNC3Q14003 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNC3Q14003 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNC3Q14003 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNC3Q14003 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNC3Q14003 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNC3Q14003 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNC3Q14003 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNC3Q14003 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNC3Q14003 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNC3Q14003 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNC3Q14003 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms