Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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