Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATMQ13315 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATMQ13315 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATMQ13315 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATMQ13315 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATMQ13315 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ATMQ13315 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATMQ13315 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATMQ13315 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATMQ13315 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATMQ13315 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATMQ13315 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATMQ13315 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATMQ13315 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATMQ13315 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATMQ13315 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATMQ13315 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATMQ13315 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATMQ13315 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATMQ13315 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATMQ13315 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATMQ13315 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ATMQ13315 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATMQ13315 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATMQ13315 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATMQ13315 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATMQ13315 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATMQ13315 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATMQ13315 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATMQ13315 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATMQ13315 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATMQ13315 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATMQ13315 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATMQ13315 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATMQ13315 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATMQ13315 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATMQ13315 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATMQ13315 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATMQ13315 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATMQ13315 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATMQ13315 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATMQ13315 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATMQ13315 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ATMQ13315 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATMQ13315 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATMQ13315 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATMQ13315 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATMQ13315 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATMQ13315 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATMQ13315 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATMQ13315 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ATMQ13315 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ATMQ13315 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATMQ13315 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATMQ13315 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATMQ13315 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATMQ13315 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATMQ13315 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATMQ13315 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATMQ13315 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATMQ13315 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATMQ13315 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATMQ13315 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATMQ13315 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATMQ13315 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATMQ13315 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATMQ13315 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATMQ13315 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATMQ13315 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATMQ13315 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ATMQ13315 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATMQ13315 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATMQ13315 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATMQ13315 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATMQ13315 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATMQ13315 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATMQ13315 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATMQ13315 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATMQ13315 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATMQ13315 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ATMQ13315 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATMQ13315 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATMQ13315 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATMQ13315 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ATMQ13315 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATMQ13315 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATMQ13315 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATMQ13315 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATMQ13315 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATMQ13315 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATMQ13315 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATMQ13315 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATMQ13315 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATMQ13315 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATMQ13315 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATMQ13315 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATMQ13315 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATMQ13315 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATMQ13315 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATMQ13315 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
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