Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
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