Protein–RNA interactions for Protein: Q12316

TY1B-GR3, Transposon Ty1-GR3 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-GR3Q12316 YMR1YJR110W 2067 nt1.64□□□□□ -2.15
TY1B-GR3Q12316 UBP16YPL072W 1500 nt1.64□□□□□ -2.15
TY1B-GR3Q12316 UTP6YDR449C 1323 nt1.64□□□□□ -2.15
TY1B-GR3Q12316 PEX14YGL153W 1026 nt1.64□□□□□ -2.15
TY1B-GR3Q12316 CDA2YLR308W 939 nt1.64□□□□□ -2.15
TY1B-GR3Q12316 RLP7YNL002C 969 nt1.64□□□□□ -2.15
TY1B-GR3Q12316 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt1.64□□□□□ -2.15
TY1B-GR3Q12316 FIR1YER032W 2631 nt1.63□□□□□ -2.15
TY1B-GR3Q12316 VMR1YHL035C 4779 nt1.63□□□□□ -2.15
TY1B-GR3Q12316 SPT14YPL175W 1359 nt1.63□□□□□ -2.15
TY1B-GR3Q12316 URC2YDR520C 2319 nt1.63□□□□□ -2.15
TY1B-GR3Q12316 BUR2YLR226W 1188 nt1.63□□□□□ -2.15
TY1B-GR3Q12316 ATX2YOR079C 942 nt1.63□□□□□ -2.15
TY1B-GR3Q12316 RKM1YPL208W 1752 nt1.63□□□□□ -2.15
TY1B-GR3Q12316 MAD1YGL086W 2250 nt1.63□□□□□ -2.15
TY1B-GR3Q12316 MYO2YOR326W 4725 nt1.62□□□□□ -2.15
TY1B-GR3Q12316 GCN2YDR283C 4980 nt1.62□□□□□ -2.15
TY1B-GR3Q12316 REV7YIL139C 738 nt1.62□□□□□ -2.15
TY1B-GR3Q12316 RLP24YLR009W 600 nt1.62□□□□□ -2.15
TY1B-GR3Q12316 YLR366WYLR366W 306 nt1.62□□□□□ -2.15
TY1B-GR3Q12316 YBR255C-AYBR255C-A 363 nt1.62□□□□□ -2.15
TY1B-GR3Q12316 UTP25YIL091C 2166 nt1.62□□□□□ -2.15
TY1B-GR3Q12316 PMI40YER003C 1290 nt1.62□□□□□ -2.15
TY1B-GR3Q12316 YMR086C-AYMR086C-A 339 nt1.62□□□□□ -2.15
TY1B-GR3Q12316 NEM1YHR004C 1341 nt1.61□□□□□ -2.15
TY1B-GR3Q12316 NDJ1YOL104C 1059 nt1.61□□□□□ -2.15
TY1B-GR3Q12316 TAZ1YPR140W 1146 nt1.61□□□□□ -2.15
TY1B-GR3Q12316 SRO9YCL037C 1305 nt1.6□□□□□ -2.15
TY1B-GR3Q12316 PTC5YOR090C 1719 nt1.6□□□□□ -2.15
TY1B-GR3Q12316 MAK5YBR142W 2322 nt1.6□□□□□ -2.15
TY1B-GR3Q12316 SWI4YER111C 3282 nt1.6□□□□□ -2.15
TY1B-GR3Q12316 YNL228WYNL228W 777 nt1.6□□□□□ -2.15
TY1B-GR3Q12316 HHF1YBR009C 312 nt1.6□□□□□ -2.15
TY1B-GR3Q12316 ATG9YDL149W 2994 nt1.59□□□□□ -2.15
TY1B-GR3Q12316 YHR182C-AYHR182C-A 474 nt1.59□□□□□ -2.15
TY1B-GR3Q12316 GPI17YDR434W 1605 nt1.59□□□□□ -2.16
TY1B-GR3Q12316 YGL193CYGL193C 312 nt1.59□□□□□ -2.16
TY1B-GR3Q12316 CDC39YCR093W 6327 nt1.59□□□□□ -2.16
TY1B-GR3Q12316 ALG8YOR067C 1734 nt1.58□□□□□ -2.16
TY1B-GR3Q12316 SPT7YBR081C 3999 nt1.58□□□□□ -2.16
TY1B-GR3Q12316 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt1.58□□□□□ -2.16
TY1B-GR3Q12316 SCC2YDR180W 4482 nt1.58□□□□□ -2.16
TY1B-GR3Q12316 RGL1YPL066W 1440 nt1.57□□□□□ -2.16
TY1B-GR3Q12316 WBP1YEL002C 1293 nt1.57□□□□□ -2.16
TY1B-GR3Q12316 YET1YKL065C 621 nt1.57□□□□□ -2.16
TY1B-GR3Q12316 YOL134CYOL134C 390 nt1.57□□□□□ -2.16
TY1B-GR3Q12316 IMG2YCR071C 441 nt1.57□□□□□ -2.16
TY1B-GR3Q12316 APA1YCL050C 966 nt1.57□□□□□ -2.16
TY1B-GR3Q12316 YMR160WYMR160W 2451 nt1.57□□□□□ -2.16
TY1B-GR3Q12316 SET4YJL105W 1683 nt1.56□□□□□ -2.16
TY1B-GR3Q12316 PEX12YMR026C 1200 nt1.56□□□□□ -2.16
TY1B-GR3Q12316 YNL011CYNL011C 1335 nt1.56□□□□□ -2.16
TY1B-GR3Q12316 IQG1YPL242C 4488 nt1.55□□□□□ -2.16
TY1B-GR3Q12316 NAM7YMR080C 2916 nt1.55□□□□□ -2.16
TY1B-GR3Q12316 IRC6YFR043C 714 nt1.55□□□□□ -2.16
TY1B-GR3Q12316 YPS5YGL259W 498 nt1.55□□□□□ -2.16
TY1B-GR3Q12316 YGR011WYGR011W 327 nt1.55□□□□□ -2.16
TY1B-GR3Q12316 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt1.54□□□□□ -2.16
TY1B-GR3Q12316 NRG1YDR043C 696 nt1.54□□□□□ -2.16
TY1B-GR3Q12316 YDR336WYDR336W 945 nt1.54□□□□□ -2.16
TY1B-GR3Q12316 VMA22YHR060W 546 nt1.54□□□□□ -2.16
TY1B-GR3Q12316 GRE2YOL151W 1029 nt1.54□□□□□ -2.16
TY1B-GR3Q12316 PCL5YHR071W 690 nt1.54□□□□□ -2.16
TY1B-GR3Q12316 MRPL6YHR147C 645 nt1.54□□□□□ -2.16
TY1B-GR3Q12316 RPA34YJL148W 702 nt1.54□□□□□ -2.16
TY1B-GR3Q12316 YPT52YKR014C 705 nt1.54□□□□□ -2.16
TY1B-GR3Q12316 YBR134WYBR134W 402 nt1.54□□□□□ -2.16
TY1B-GR3Q12316 YIL080WYIL080W 4722 nt1.54□□□□□ -2.16
TY1B-GR3Q12316 MTL1YGR023W 1656 nt1.53□□□□□ -2.16
TY1B-GR3Q12316 YDL211CYDL211C 1119 nt1.53□□□□□ -2.16
TY1B-GR3Q12316 YBR174CYBR174C 315 nt1.53□□□□□ -2.16
TY1B-GR3Q12316 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.52□□□□□ -2.17
TY1B-GR3Q12316 GPM2YDL021W 936 nt1.52□□□□□ -2.17
TY1B-GR3Q12316 RAD18YCR066W 1464 nt1.51□□□□□ -2.17
TY1B-GR3Q12316 SKI8YGL213C 1194 nt1.51□□□□□ -2.17
TY1B-GR3Q12316 ARG3YJL088W 1017 nt1.51□□□□□ -2.17
TY1B-GR3Q12316 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt1.51□□□□□ -2.17
TY1B-GR3Q12316 PBI1YPL272C 1554 nt1.51□□□□□ -2.17
TY1B-GR3Q12316 PBY1YBR094W 2262 nt1.51□□□□□ -2.17
TY1B-GR3Q12316 LSM6YDR378C 261 nt1.5□□□□□ -2.17
TY1B-GR3Q12316 MRPL44YMR225C 297 nt1.5□□□□□ -2.17
TY1B-GR3Q12316 HSP10YOR020C 321 nt1.5□□□□□ -2.17
TY1B-GR3Q12316 PSP1YDR505C 2526 nt1.5□□□□□ -2.17
TY1B-GR3Q12316 PGD1YGL025C 1194 nt1.49□□□□□ -2.17
TY1B-GR3Q12316 OTU2YHL013C 924 nt1.49□□□□□ -2.17
TY1B-GR3Q12316 YIL086CYIL086C 309 nt1.49□□□□□ -2.17
TY1B-GR3Q12316 EGD1YPL037C 474 nt1.49□□□□□ -2.17
TY1B-GR3Q12316 MGA1YGR249W 1371 nt1.49□□□□□ -2.17
TY1B-GR3Q12316 PET127YOR017W 2403 nt1.48□□□□□ -2.17
TY1B-GR3Q12316 MNT3YIL014W 1893 nt1.48□□□□□ -2.17
TY1B-GR3Q12316 COS12YGL263W 1143 nt1.48□□□□□ -2.17
TY1B-GR3Q12316 TDA10YGR205W 873 nt1.48□□□□□ -2.17
TY1B-GR3Q12316 VPS71YML041C 843 nt1.48□□□□□ -2.17
TY1B-GR3Q12316 COQ10YOL008W 624 nt1.48□□□□□ -2.17
TY1B-GR3Q12316 MON2YNL297C 4911 nt1.48□□□□□ -2.17
TY1B-GR3Q12316 YCT1YLL055W 1596 nt1.48□□□□□ -2.17
TY1B-GR3Q12316 FMP27YLR454W 7887 nt1.48□□□□□ -2.17
TY1B-GR3Q12316 YKL100CYKL100C 1764 nt1.48□□□□□ -2.17
TY1B-GR3Q12316 RPH1YER169W 2391 nt1.47□□□□□ -2.17
TY1B-GR3Q12316 MCM22YJR135C 720 nt1.47□□□□□ -2.17
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