Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms