Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXM1Q08050 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms