Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FMODQ06828 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FMODQ06828 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FMODQ06828 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FMODQ06828 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FMODQ06828 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FMODQ06828 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FMODQ06828 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FMODQ06828 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FMODQ06828 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FMODQ06828 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FMODQ06828 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FMODQ06828 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FMODQ06828 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FMODQ06828 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FMODQ06828 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FMODQ06828 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FMODQ06828 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FMODQ06828 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FMODQ06828 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FMODQ06828 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FMODQ06828 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FMODQ06828 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FMODQ06828 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FMODQ06828 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FMODQ06828 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FMODQ06828 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FMODQ06828 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FMODQ06828 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FMODQ06828 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FMODQ06828 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FMODQ06828 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FMODQ06828 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FMODQ06828 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FMODQ06828 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FMODQ06828 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FMODQ06828 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FMODQ06828 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FMODQ06828 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FMODQ06828 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FMODQ06828 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FMODQ06828 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FMODQ06828 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FMODQ06828 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FMODQ06828 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FMODQ06828 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FMODQ06828 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FMODQ06828 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FMODQ06828 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FMODQ06828 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FMODQ06828 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FMODQ06828 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FMODQ06828 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FMODQ06828 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FMODQ06828 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FMODQ06828 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FMODQ06828 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FMODQ06828 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FMODQ06828 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FMODQ06828 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FMODQ06828 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FMODQ06828 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FMODQ06828 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FMODQ06828 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FMODQ06828 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FMODQ06828 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FMODQ06828 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FMODQ06828 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FMODQ06828 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FMODQ06828 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FMODQ06828 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FMODQ06828 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FMODQ06828 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FMODQ06828 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FMODQ06828 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FMODQ06828 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FMODQ06828 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FMODQ06828 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FMODQ06828 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FMODQ06828 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FMODQ06828 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FMODQ06828 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FMODQ06828 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FMODQ06828 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FMODQ06828 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FMODQ06828 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FMODQ06828 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FMODQ06828 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FMODQ06828 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FMODQ06828 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FMODQ06828 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FMODQ06828 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FMODQ06828 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FMODQ06828 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FMODQ06828 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FMODQ06828 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FMODQ06828 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FMODQ06828 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FMODQ06828 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FMODQ06828 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms