Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSME1Q06323 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PSME1Q06323 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms