Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms