Protein–RNA interactions for Protein: Q03167

TGFBR3, Transforming growth factor beta receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR3Q03167 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms