Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDK6Q00534 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms