Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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FAM3AP98173 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
FAM3AP98173 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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