Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms