Protein–RNA interactions for Protein: P78332

RBM6, RNA-binding protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM6P78332 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RBM6P78332 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RBM6P78332 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RBM6P78332 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RBM6P78332 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RBM6P78332 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RBM6P78332 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RBM6P78332 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RBM6P78332 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RBM6P78332 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RBM6P78332 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RBM6P78332 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RBM6P78332 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RBM6P78332 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBM6P78332 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RBM6P78332 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBM6P78332 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBM6P78332 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBM6P78332 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBM6P78332 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBM6P78332 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBM6P78332 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBM6P78332 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBM6P78332 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RBM6P78332 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBM6P78332 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBM6P78332 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBM6P78332 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBM6P78332 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBM6P78332 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBM6P78332 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBM6P78332 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBM6P78332 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBM6P78332 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBM6P78332 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBM6P78332 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBM6P78332 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBM6P78332 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBM6P78332 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBM6P78332 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RBM6P78332 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RBM6P78332 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBM6P78332 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBM6P78332 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM6P78332 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM6P78332 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM6P78332 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM6P78332 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM6P78332 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM6P78332 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM6P78332 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM6P78332 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM6P78332 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM6P78332 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM6P78332 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM6P78332 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM6P78332 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM6P78332 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM6P78332 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM6P78332 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM6P78332 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM6P78332 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM6P78332 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBM6P78332 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBM6P78332 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBM6P78332 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBM6P78332 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBM6P78332 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBM6P78332 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBM6P78332 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBM6P78332 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBM6P78332 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RBM6P78332 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RBM6P78332 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RBM6P78332 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RBM6P78332 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RBM6P78332 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RBM6P78332 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RBM6P78332 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RBM6P78332 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RBM6P78332 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
RBM6P78332 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RBM6P78332 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RBM6P78332 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RBM6P78332 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RBM6P78332 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RBM6P78332 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RBM6P78332 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RBM6P78332 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RBM6P78332 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RBM6P78332 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RBM6P78332 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RBM6P78332 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RBM6P78332 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RBM6P78332 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RBM6P78332 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RBM6P78332 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RBM6P78332 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RBM6P78332 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RBM6P78332 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms