Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTBP60709 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTBP60709 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTBP60709 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTBP60709 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACTBP60709 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACTBP60709 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACTBP60709 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACTBP60709 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACTBP60709 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACTBP60709 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACTBP60709 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACTBP60709 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTBP60709 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTBP60709 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTBP60709 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTBP60709 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTBP60709 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTBP60709 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTBP60709 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTBP60709 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTBP60709 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTBP60709 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTBP60709 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTBP60709 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTBP60709 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTBP60709 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTBP60709 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTBP60709 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTBP60709 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTBP60709 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTBP60709 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTBP60709 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTBP60709 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTBP60709 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTBP60709 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTBP60709 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTBP60709 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTBP60709 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTBP60709 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTBP60709 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTBP60709 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTBP60709 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTBP60709 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTBP60709 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTBP60709 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTBP60709 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTBP60709 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTBP60709 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTBP60709 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTBP60709 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTBP60709 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTBP60709 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTBP60709 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTBP60709 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTBP60709 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTBP60709 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTBP60709 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTBP60709 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTBP60709 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTBP60709 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTBP60709 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTBP60709 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTBP60709 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTBP60709 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTBP60709 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTBP60709 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTBP60709 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTBP60709 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTBP60709 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTBP60709 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTBP60709 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTBP60709 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTBP60709 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTBP60709 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTBP60709 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTBP60709 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTBP60709 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTBP60709 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTBP60709 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTBP60709 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTBP60709 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTBP60709 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTBP60709 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTBP60709 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTBP60709 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTBP60709 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTBP60709 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTBP60709 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTBP60709 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTBP60709 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTBP60709 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTBP60709 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTBP60709 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTBP60709 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTBP60709 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTBP60709 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTBP60709 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTBP60709 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTBP60709 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms