Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms