Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLF3P57682 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLF3P57682 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLF3P57682 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLF3P57682 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLF3P57682 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLF3P57682 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLF3P57682 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLF3P57682 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLF3P57682 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLF3P57682 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLF3P57682 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLF3P57682 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLF3P57682 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLF3P57682 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KLF3P57682 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLF3P57682 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLF3P57682 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLF3P57682 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLF3P57682 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLF3P57682 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLF3P57682 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLF3P57682 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLF3P57682 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLF3P57682 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLF3P57682 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLF3P57682 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLF3P57682 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLF3P57682 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLF3P57682 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLF3P57682 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLF3P57682 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLF3P57682 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLF3P57682 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLF3P57682 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLF3P57682 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLF3P57682 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLF3P57682 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLF3P57682 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KLF3P57682 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLF3P57682 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLF3P57682 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KLF3P57682 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KLF3P57682 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLF3P57682 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLF3P57682 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KLF3P57682 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLF3P57682 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLF3P57682 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLF3P57682 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLF3P57682 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLF3P57682 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLF3P57682 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLF3P57682 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLF3P57682 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLF3P57682 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLF3P57682 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KLF3P57682 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLF3P57682 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KLF3P57682 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLF3P57682 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLF3P57682 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLF3P57682 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLF3P57682 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KLF3P57682 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLF3P57682 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLF3P57682 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLF3P57682 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLF3P57682 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLF3P57682 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLF3P57682 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLF3P57682 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLF3P57682 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLF3P57682 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLF3P57682 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLF3P57682 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLF3P57682 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLF3P57682 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLF3P57682 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
KLF3P57682 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLF3P57682 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLF3P57682 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLF3P57682 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLF3P57682 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLF3P57682 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
KLF3P57682 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLF3P57682 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLF3P57682 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLF3P57682 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLF3P57682 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLF3P57682 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLF3P57682 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLF3P57682 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
KLF3P57682 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF3P57682 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF3P57682 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF3P57682 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF3P57682 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF3P57682 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF3P57682 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms