Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GSCP56915 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GSCP56915 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GSCP56915 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GSCP56915 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GSCP56915 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GSCP56915 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GSCP56915 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GSCP56915 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GSCP56915 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GSCP56915 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GSCP56915 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GSCP56915 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GSCP56915 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GSCP56915 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GSCP56915 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GSCP56915 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GSCP56915 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GSCP56915 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GSCP56915 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GSCP56915 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GSCP56915 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GSCP56915 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GSCP56915 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GSCP56915 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GSCP56915 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GSCP56915 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GSCP56915 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GSCP56915 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GSCP56915 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GSCP56915 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GSCP56915 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GSCP56915 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GSCP56915 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GSCP56915 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GSCP56915 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GSCP56915 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GSCP56915 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GSCP56915 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GSCP56915 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GSCP56915 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GSCP56915 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GSCP56915 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GSCP56915 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GSCP56915 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GSCP56915 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GSCP56915 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GSCP56915 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GSCP56915 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GSCP56915 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GSCP56915 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GSCP56915 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GSCP56915 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GSCP56915 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GSCP56915 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GSCP56915 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GSCP56915 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GSCP56915 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GSCP56915 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GSCP56915 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GSCP56915 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GSCP56915 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GSCP56915 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GSCP56915 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GSCP56915 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GSCP56915 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GSCP56915 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GSCP56915 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GSCP56915 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GSCP56915 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GSCP56915 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GSCP56915 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GSCP56915 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GSCP56915 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GSCP56915 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GSCP56915 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GSCP56915 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GSCP56915 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GSCP56915 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GSCP56915 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GSCP56915 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GSCP56915 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GSCP56915 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GSCP56915 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GSCP56915 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GSCP56915 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GSCP56915 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GSCP56915 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GSCP56915 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GSCP56915 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GSCP56915 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GSCP56915 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GSCP56915 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GSCP56915 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GSCP56915 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GSCP56915 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GSCP56915 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GSCP56915 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GSCP56915 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GSCP56915 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms